儲糧專用制氮機制氮系統主要由三部份組成：空氣壓縮、空氣凈化、氮氧分離與輸送。

空氣由壓縮機壓縮至7.0-8.5Bar經凈化系統中的三級過濾器、冷凍式干燥機、活性炭除油器，將空氣中的大部分水份、油份以及一些顆粒性雜質除去，再提供給后面的制氮機主機。當空氣進入制氮機主機兩吸附塔，塔內專門配置的吸氧的高性能碳分子篩，在加壓下根據對空氣中氮氣和氧氣的不同的“選擇吸附性”由閥門的自動切換，實現兩塔的加壓吸附、放壓解吸的變壓吸附過程。也就是說在加壓情況下分子篩將氧吸附起來另氮氣通過并被收集、輸送。當吸附飽和后自動切換到另外吸附塔加壓吸附，制氮機主機本塔則放空并排出所吸附的氧氣，因此交替往復連續制造出高濃度的氮氣的工藝過程。